Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U90926O08546 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U90926O08546 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U90926O08546 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U90926O08546 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U90926O08546 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U90926O08546 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U90926O08546 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U90926O08546 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U90926O08546 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U90926O08546 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U90926O08546 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U90926O08546 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U90926O08546 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U90926O08546 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U90926O08546 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U90926O08546 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U90926O08546 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U90926O08546 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U90926O08546 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U90926O08546 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U90926O08546 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U90926O08546 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U90926O08546 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U90926O08546 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U90926O08546 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U90926O08546 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U90926O08546 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U90926O08546 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U90926O08546 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U90926O08546 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U90926O08546 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U90926O08546 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U90926O08546 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U90926O08546 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U90926O08546 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U90926O08546 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U90926O08546 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U90926O08546 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U90926O08546 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U90926O08546 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U90926O08546 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U90926O08546 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U90926O08546 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U90926O08546 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U90926O08546 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U90926O08546 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U90926O08546 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U90926O08546 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U90926O08546 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
U90926O08546 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U90926O08546 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U90926O08546 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U90926O08546 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
U90926O08546 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
U90926O08546 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
U90926O08546 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U90926O08546 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U90926O08546 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
U90926O08546 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U90926O08546 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U90926O08546 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U90926O08546 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U90926O08546 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U90926O08546 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U90926O08546 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U90926O08546 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U90926O08546 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U90926O08546 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U90926O08546 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
U90926O08546 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U90926O08546 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U90926O08546 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U90926O08546 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U90926O08546 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
U90926O08546 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U90926O08546 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U90926O08546 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U90926O08546 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U90926O08546 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U90926O08546 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U90926O08546 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U90926O08546 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U90926O08546 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U90926O08546 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U90926O08546 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
U90926O08546 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U90926O08546 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U90926O08546 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U90926O08546 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U90926O08546 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U90926O08546 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U90926O08546 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U90926O08546 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U90926O08546 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U90926O08546 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U90926O08546 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U90926O08546 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U90926O08546 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U90926O08546 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms