Protein–RNA interactions for Protein: J3QP60

A630023A22Rik, RIKEN cDNA A630023A22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630023A22RikJ3QP60 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A630023A22RikJ3QP60 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A630023A22RikJ3QP60 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A630023A22RikJ3QP60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A630023A22RikJ3QP60 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A630023A22RikJ3QP60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A630023A22RikJ3QP60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A630023A22RikJ3QP60 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A630023A22RikJ3QP60 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A630023A22RikJ3QP60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A630023A22RikJ3QP60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A630023A22RikJ3QP60 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A630023A22RikJ3QP60 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A630023A22RikJ3QP60 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A630023A22RikJ3QP60 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A630023A22RikJ3QP60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A630023A22RikJ3QP60 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A630023A22RikJ3QP60 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A630023A22RikJ3QP60 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms