Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Usp32F8VPZ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Usp32F8VPZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Usp32F8VPZ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Usp32F8VPZ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Usp32F8VPZ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Usp32F8VPZ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Usp32F8VPZ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Usp32F8VPZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Usp32F8VPZ3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Usp32F8VPZ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Usp32F8VPZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Usp32F8VPZ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Usp32F8VPZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Usp32F8VPZ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Usp32F8VPZ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Usp32F8VPZ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Usp32F8VPZ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Usp32F8VPZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Usp32F8VPZ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Usp32F8VPZ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Usp32F8VPZ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Usp32F8VPZ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Usp32F8VPZ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Usp32F8VPZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Usp32F8VPZ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Usp32F8VPZ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Usp32F8VPZ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms