Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Aknad1E9Q8N6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Aknad1E9Q8N6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Aknad1E9Q8N6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Aknad1E9Q8N6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Aknad1E9Q8N6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Aknad1E9Q8N6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Aknad1E9Q8N6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Aknad1E9Q8N6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Aknad1E9Q8N6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Aknad1E9Q8N6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Aknad1E9Q8N6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Aknad1E9Q8N6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Aknad1E9Q8N6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Aknad1E9Q8N6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Aknad1E9Q8N6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Aknad1E9Q8N6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Aknad1E9Q8N6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Aknad1E9Q8N6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Aknad1E9Q8N6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Aknad1E9Q8N6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Aknad1E9Q8N6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Aknad1E9Q8N6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Aknad1E9Q8N6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Aknad1E9Q8N6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Aknad1E9Q8N6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Aknad1E9Q8N6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Aknad1E9Q8N6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Aknad1E9Q8N6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Aknad1E9Q8N6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Aknad1E9Q8N6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Aknad1E9Q8N6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Aknad1E9Q8N6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Aknad1E9Q8N6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Aknad1E9Q8N6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Aknad1E9Q8N6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Aknad1E9Q8N6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Aknad1E9Q8N6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Aknad1E9Q8N6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Aknad1E9Q8N6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Aknad1E9Q8N6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Aknad1E9Q8N6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aknad1E9Q8N6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aknad1E9Q8N6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aknad1E9Q8N6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Aknad1E9Q8N6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Aknad1E9Q8N6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms