Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms