Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtproE9Q612 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtproE9Q612 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtproE9Q612 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PtproE9Q612 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtproE9Q612 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtproE9Q612 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtproE9Q612 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms