Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Hfm1D3Z4R1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Hfm1D3Z4R1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Hfm1D3Z4R1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Hfm1D3Z4R1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Hfm1D3Z4R1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Hfm1D3Z4R1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Hfm1D3Z4R1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Hfm1D3Z4R1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
Hfm1D3Z4R1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hfm1D3Z4R1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hfm1D3Z4R1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hfm1D3Z4R1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Hfm1D3Z4R1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Hfm1D3Z4R1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Hfm1D3Z4R1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Hfm1D3Z4R1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Hfm1D3Z4R1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Hfm1D3Z4R1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Hfm1D3Z4R1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Hfm1D3Z4R1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Hfm1D3Z4R1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Hfm1D3Z4R1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Hfm1D3Z4R1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Hfm1D3Z4R1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Hfm1D3Z4R1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Hfm1D3Z4R1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Hfm1D3Z4R1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Hfm1D3Z4R1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Hfm1D3Z4R1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Hfm1D3Z4R1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Hfm1D3Z4R1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Hfm1D3Z4R1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Hfm1D3Z4R1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Hfm1D3Z4R1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Hfm1D3Z4R1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Hfm1D3Z4R1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Hfm1D3Z4R1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Hfm1D3Z4R1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Hfm1D3Z4R1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Hfm1D3Z4R1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Hfm1D3Z4R1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Hfm1D3Z4R1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Hfm1D3Z4R1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Hfm1D3Z4R1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Hfm1D3Z4R1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Hfm1D3Z4R1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Hfm1D3Z4R1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Hfm1D3Z4R1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Hfm1D3Z4R1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Hfm1D3Z4R1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Hfm1D3Z4R1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Hfm1D3Z4R1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms