Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CatipB9EKE5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CatipB9EKE5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CatipB9EKE5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CatipB9EKE5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CatipB9EKE5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CatipB9EKE5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CatipB9EKE5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CatipB9EKE5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CatipB9EKE5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CatipB9EKE5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CatipB9EKE5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CatipB9EKE5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CatipB9EKE5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CatipB9EKE5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CatipB9EKE5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CatipB9EKE5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CatipB9EKE5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CatipB9EKE5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CatipB9EKE5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CatipB9EKE5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CatipB9EKE5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CatipB9EKE5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CatipB9EKE5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CatipB9EKE5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CatipB9EKE5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CatipB9EKE5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CatipB9EKE5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CatipB9EKE5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.77■■■■□ 3
CatipB9EKE5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CatipB9EKE5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CatipB9EKE5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CatipB9EKE5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CatipB9EKE5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CatipB9EKE5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CatipB9EKE5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CatipB9EKE5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CatipB9EKE5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CatipB9EKE5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CatipB9EKE5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CatipB9EKE5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CatipB9EKE5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CatipB9EKE5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CatipB9EKE5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CatipB9EKE5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CatipB9EKE5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CatipB9EKE5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CatipB9EKE5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms