Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trabd2bB1ATG9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trabd2bB1ATG9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trabd2bB1ATG9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trabd2bB1ATG9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trabd2bB1ATG9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trabd2bB1ATG9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms