Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms