Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
GabreA2AMW3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
GabreA2AMW3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
GabreA2AMW3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
GabreA2AMW3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
GabreA2AMW3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
GabreA2AMW3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29,95■■■□□ 2,39
GabreA2AMW3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,93■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
GabreA2AMW3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,84■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
GabreA2AMW3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
GabreA2AMW3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
GabreA2AMW3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
GabreA2AMW3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
GabreA2AMW3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
GabreA2AMW3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
GabreA2AMW3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
GabreA2AMW3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,74■■■□□ 2,35
GabreA2AMW3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
GabreA2AMW3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
GabreA2AMW3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
GabreA2AMW3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
GabreA2AMW3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
GabreA2AMW3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
GabreA2AMW3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
GabreA2AMW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
GabreA2AMW3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,59■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
GabreA2AMW3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,56■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
GabreA2AMW3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
GabreA2AMW3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29,44■■■□□ 2,3
GabreA2AMW3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
GabreA2AMW3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
GabreA2AMW3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
GabreA2AMW3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,4■■■□□ 2,3
GabreA2AMW3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
GabreA2AMW3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
GabreA2AMW3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
GabreA2AMW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms