Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GabreA2AMW3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GabreA2AMW3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GabreA2AMW3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GabreA2AMW3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GabreA2AMW3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GabreA2AMW3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GabreA2AMW3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GabreA2AMW3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GabreA2AMW3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GabreA2AMW3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GabreA2AMW3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GabreA2AMW3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GabreA2AMW3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GabreA2AMW3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GabreA2AMW3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GabreA2AMW3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GabreA2AMW3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GabreA2AMW3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GabreA2AMW3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GabreA2AMW3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GabreA2AMW3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GabreA2AMW3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GabreA2AMW3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GabreA2AMW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GabreA2AMW3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GabreA2AMW3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GabreA2AMW3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GabreA2AMW3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GabreA2AMW3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GabreA2AMW3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GabreA2AMW3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GabreA2AMW3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GabreA2AMW3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GabreA2AMW3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GabreA2AMW3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GabreA2AMW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GabreA2AMW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms