Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc39aA2ACP1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc39aA2ACP1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc39aA2ACP1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ttc39aA2ACP1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc39aA2ACP1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc39aA2ACP1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc39aA2ACP1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc39aA2ACP1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc39aA2ACP1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc39aA2ACP1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc39aA2ACP1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc39aA2ACP1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc39aA2ACP1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc39aA2ACP1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc39aA2ACP1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms