Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC61Q9Y6R9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms