Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUBP2Q9Y5Y2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUBP2Q9Y5Y2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms