Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms