Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.1
DCAF1Q9Y4B6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
DCAF1Q9Y4B6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
DCAF1Q9Y4B6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
DCAF1Q9Y4B6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
DCAF1Q9Y4B6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms