Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL11Q9Y3B7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms