Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF5Q9Y2D1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms