Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms