Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC6Q9Y210 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms