Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms