Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRAK1Q9UPV9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms