Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP164Q9UPV0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CEP164Q9UPV0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms