Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms