Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHTF1Q9UMS5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms