Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO4Q9UKT5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO4Q9UKT5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms