Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP3Q9UKI2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms