Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms