Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFMBT1Q9UHJ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms