Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms