Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms