Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms