Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRP1BQ9NZR2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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