Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX43Q9NXZ2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms