Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms