Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK13-1Q9NX77 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms