Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms