Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A7Q9NVC3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms