Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms