Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms