Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms