Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMYD2Q9NRG4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMYD2Q9NRG4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms