Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC31BQ9NQW1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms