Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms