Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA8Q9NP80 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA8Q9NP80 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms