Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms