Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKRIP1Q9H875 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms