Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUDS3Q9H7L9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms