Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLMPQ9H6B4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLMPQ9H6B4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLMPQ9H6B4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLMPQ9H6B4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLMPQ9H6B4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms