Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF41Q9H4P4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms