Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIPK3Q9H422 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIPK3Q9H422 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms